А чем этот не устраивает? Или просто не хочется корёжить правила?
Тогда написать свою обработку, которая будет запускаться после обмена, по всем документам пересчитывать суммы и записывать в режиме ОбменДанными.Загрузка = Истина.
TurboConf — расширение возможностей Конфигуратора 1С