Добрый день!
Вот такая проблема у меня , использую 1С Старт Fresh. Делаю ОСВ по 60 счету у контрагента выходит два основных договора по одному списание с р/с счета , по другому поступление ТМЦ. Из за это сумма аванса и задолженности выходить одинаковая. Как сделать так чтобы все проходило по одному договору .
Заранее спасибо.

только причем здесь Основной договор? когда просто разные договора

Да разные договоры , каков алгоритм чтобы все в одном договоре было?

Алгоритм. Во всех документах установить один договор.

Можно поиском и удалением дублей (НСИ и администрирование - Обслуживание).