Я несколько раз делал публикацию базы вполне штатными средствами (через конфигуратор).

а как опубликовать при условии, что на сервере конфигуратор запустить невозможно (причины опустим).

сервер на консольном лине с апечем...

Поправить httpd.conf руками и положить в каталог сайта default.vrd

Изменения httpd.conf сводятся к загрузке модуля апача и организации виртуальной директории - можно увидеть, опубликовав аналогичное локально.

нашел инструкцию, буду пробовать http://catalog.mista.ru/public/303420/

Когда нельзя запустить конфигуратор (или когда хочется опубликовать через 64б расширение веб-сервера), Я использую консольную утилиту webinst.
Когда нельзя использовать и webinst, тогда ручками по методике из (1)