Во вкладке "Начисления" указан только результат без учета вычетов.
http://prntscr.com/bv4nra А поле "начисление" пустое, как бы программа не понимает что она начисляет.
Отсюда и вопрос, как и где указать, что документ отпуск должен использовать именно этот тип начисления(в котором уже прописан процент ндфл)
Пользователь не знает, чего он хочет, пока не увидит то, что он получил. Эдвард Йодан