Обновил УНФ последовательно с 1.4 до 1.6. Сначала сделал тестовую базу. На ней выявил проблему: автоматом не подставлялись цены в документы (например, заказы покупателей). Дальше начал разбираться и, по-моему, помогло регламентное задание "обработка очереди цен". Запустил, регистр "Цены номенклатуры" перезаполнился, все заработало.
Обновил рабочую, не могу повторить то же самое.
Возможно, не то регламентное задание запускал, или вообще обработку. Никто не сталкивался?

Внезапно разобрался. В справочнике "виды цен" есть реквизит с количеством попыток. Их надо обнулить, тогда регламентное задание отработает. В коде условие количество попыток < 2, а везде стоит 2.