Чтобы не болтались в минусах?

(0) Найти причину и исправить.

создать корректировку записей регистров))

на тебе овнокод

НовыйДок = Документы.КорректировкаЗаписейРегистров.СоздатьДокумент();
    НовыйДок.Дата = ДатаОстатков -1;
    НовыйДок.Ответственный = ПараметрыСеанса.ТекущийПользователь;
    
    СтрокаТЧ=НовыйДок.ТаблицаРегистровНакопления.Добавить();
    СтрокаТЧ.Имя = "УчетЗатратРегл";
    СтрокаТЧ.Представление = "УчетЗатратРегл";
    ДвиженияУчетЗатрат = НовыйДок.Движения.УчетЗатратРегл;

    Запрос=новый Запрос;
    Запрос.Текст="ВЫБРАТЬ
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.АналитикаВидаУчета,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.АналитикаУчетаЗатрат,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.АналитикаУчетаПартий,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.АналитикаРаспределенияЗатрат,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.КоличествоОстаток КАК Количество,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.КоличествоНУОстаток КАК КоличествоНУ,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.СтоимостьОстаток КАК Стоимость,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.СтоимостьНУОстаток КАК СтоимостьНУ,
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.ПостояннаяРазницаОстаток КАК ПостояннаяРазница
                 |ИЗ
                 |    РегистрНакопления.УчетЗатратРегл.Остатки(&Дата, ) КАК УчетЗатратРеглОстатки
                 |ГДЕ
                 |    УчетЗатратРеглОстатки.КоличествоОстаток < 0";
    Запрос.УстановитьПараметр("Дата", ДатаОстатков);
    ТЗРезультат = Запрос.Выполнить().Выгрузить();    
    ДвиженияУчетЗатрат.Загрузить(ТЗРезультат);
    Для Каждого СтрокаДвижений Из  ДвиженияУчетЗатрат Цикл
        
        СтрокаДвижений.Активность = Истина;
        СтрокаДвижений.ВидДвижения = ВидДвиженияНакопления.Расход;
        СтрокаДвижений.Период = ДатаОстатков - 1;
        
    КонецЦикла;
    
    НовыйДок.Записать();
    Сообщить(НовыйДок);

(1) а по-типовому никак
(3) спасибо, но хотелось бы блеснуть типовым способом. Никак? типа оприходования затрат какого-нибудь

(4) "оприходование затрат"
Звучит, тебе в бизнес -аналитики надо

Типовой способ: отчет по регистру учета затрат с группировками только по измерениям - увидишь, где вышел перекос (например, где-то качество указано в ключе аналитики, где-то - не указано)
Запрос для вычленения отрицательных остатков возьмешь из кода, где РСВ тебе ругается на наличие отрицательных остатков