Окно объединения показывает неразрешимые ссылки, обнаружены ссылки на следующие объекты помеченные на удаление.
Например Общий модуль тестирование, в конфигурации есть, а в конфигурации поставщика нет, убираю галочку , обновление происходит, но потом ..... дублирование объектов метаданных.
Релиз платформы 1С:Предприятие 8.3 (8.3.7.1873).
Думаю , что это ошибка релиза платформы.
потом можно путем поиска понять какой модуль из них правильный и старый переименовать в дубль и возможно, что все будет правильно работать, но как это неправильно.
Удалить его сложно он имеет ссылки и это не единственный объект.
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший