Подскажите, что делать?

Ни разу не писал правила, так ко всему еще и коды у номенклатуры двух баз разные, благо что название одинаковые, так что их здесь можно объединить.

Подскажите как вообще научиться писать правила..или проще через excel перегонять накладные?

(0)Большие сомнения что все наименования совпадут

только практика, только хардкор

(0) Ничего сложного в КД нет. Ставь и тренируйся. Перегонять через Excel - это "поганый изврат".

(3) А есть какие-то хорошие материалы что бы почитать про обмены?

(4) Да полно. И бесплатные, и платные.