Процедура ОбработкаУдаленияПроведения()  
   Спр = СоздатьОбъект("Справочник.КонтрольЗаявок");
   Спр.ВыбратьЭлементыПоРеквизиту("Реализация",ТекущийДокумент(),1,0);
   Пока Спр.ПолучитьЭлемент() = 1 Цикл
       Сообщить(Спр.ПолучитьАтрибут("Заявка"));
       Спр.УстановитьАтрибут("Реализация","");
       Спр.Записать();
   КонецЦикла;
КонецПроцедуры

Если закоментарить строку Спр.Записать(); обрабатываются все выбранные элементы справочника, но естественно элемент справочника не записывается. Если же оставить строку, выборка останавливается на первом же элементе и дальше выбранные элементы не обрабатываются.
Почему?

1с кривая и глючная программа

(1) ну я серьезно, как отредактировать выбранные элементы справочника?

(2) явно не так

Записывай сначало в список, а потом беги по списку

если просто удалять выбранные элементы все работает, мне то нужно при отмене проведения очистить соответствующие реквизиты справочника

собирай элементы в список и по нему изменяй
ты сбиваешь выборку

(5) Спс

..интересно, а внутри транзакции выборка тоже будет сбиваться? =)

(7) однозначно.