Бухгалтерия 2.0

В каком месте присваивается префикс к номеру документа?

В подписках на событиях искали?

Наверное, в подписке на событие:
ПриЗаписи, для всех видов документов она - так по крайней мере в УПП 1.3, в общем модуле ОбщегоНазначения было

(1) Их там много. Может какую процедуру искать типа: УстановитьНовыйНомер

ПриУстановкеНовогоНомераДокумента, вестимо

(4) Это перехват события. А изначально где префикс к номеру присваивается?

(4) Прошу пардон. Все верно.

засесть на тропе, и когда будет пробегать, завалить и затоптать))

Вернее сам префикс присваивается в ДобавитьПрефиксОрганизации

(7)А если баба? Тоже затоптать?