Добрый вечер! Подскажите пожалуйста примерную структуру запроса по регистру бухгалтерии для закрытия дебиторки по фифо. Может кто то уже писал дебиторку по срокам долга с детализацией до документа с закрытием по Фифо для бухгалтерии.

А разве в БП 2.0 этого нет?

(1) Отчет есть, но закрывать задолженность по фифо в разрезе документов он не умеет.

Сам Отчет и не обязан ничего уметь.
А вот механизм для закрытия долгов по фифо в БП 2.0 - есть.
Посмотри, например, реквизит СпособПогашенияЗадолженности в приходнике.

(2) А причем тут отчет, если та и так по ФИФО закрывается?