В 1 базу будет сливаться информация из 2-х баз. Я завел регистр сведений "СоответствиеИд"(УзелОбмена, ИдПриемника, ИдОтправителя) в приемнике. Правильно ли я пнимаю, что теперь я не могу воспользоваться функцией ПрочитатьXML? Так эта функция будет пытаться найти объект по неправильному GUID?

Если ты СУМЕЛ в приемнике добавить что-то в конфигуратор, то значит эта база не была РБД, и значит обмен уже не происходил так как ты подозреваешь

Я как раз и пишу обмен, он вообще не проиходил. То есть мне надо парсить файл обмена как произвольный ХМЛ файл?

(2) КД воспользоваться у меня тоже не получится из за этого регистра?

2(3) у тебя даже получится воспользоваться не только КД но и обработкой ВыгрузкаЗагрузкаДанныхХМЛ.епф с ИТС, при условии что ты будешь переносить только объекты у которых одинаковый состав, порядок и типы реквизитов.