Формирую отчет по регистру НДС предъявленный в бухгалтерии по одной счет фактуре Выдает два остатка на начало,только один положительный,а другой отрицательный.В чем может быть дело ?

а в сумме дают ноль

различаются только на одно поле даты оплаты,что делать ?

Назвать конфу.

Скорей всего дата оплаты - измерение.
Не выбирать поле дата оплаты (или групировать макс/мин)в запросе для отчета.

Или посмотреть каками документами получились данные записи в регистре и попробовать исправить ситуацию

каками = какими*

Бухгалтерия предприятия, редакция 2.0 (2.0.22.2)

дело в том что по другим документам все нормально,а вот некоторым вот такая картина.И из-за этого книга покупок не так формируется