Нашла ответ!
код 26 в СФ поставить нельзя, потому что он означает "счета-фактуры не составляются по согласию сторон" - т.е. для кода 26 нужно, чтобы СФ не было!
Его можно проставить в документе "Отражение начисления НДС", который будет попадать в книгу продаж с кодом 26.
(4) Ага, не знала.
Теперь новая проблема - СФ на корректьировку попадает в книгу продаж, только если в корректировке выбрать "только в системе НДС", а если "во всех системах учета", то не попадает.