Никак не домучаю эту тему.
По реализации на экспорт помимо прочих проводок идет проводка  19.07 - 19.05 по ндс, который уже был зачтен. Параллельно идет запись в регистр НДС предъявленный реализация 0%.
В конце квартала документ "Восстановление НДС" должен счет 19.05 закрыть - на 68.02, при этом документ заполняется на основании остатков по регистру "НДС предъявленный реализация 0%", а в нем ведь есть даные и за прошлый квартал! Подтверждение ведь приходит часто в следующем квартале! В итоге 19.05 закрывается на бОльшие суммы, на те, которых там нет, потому что документы по прошлому кварталу по 19.05 закрылись в прошлом квартале!
Что тут не так?

И еще при заполнении документа нет отбора в регистре по состоянию "ожидается подтверждение", получается, что туда могут попасть и остатки с состоянием "подтверждена реализация".

на 19.05 восстанавливается обычный НДС(не 0%),
с 19.07 к зачету берется, когда произойдет подтверждение (или не подтверждение)

Что значит - обычный? Я смотрю, что проводки эти идут только по документам на экспорт.

С 19.07 я разобралась, там своя проблема дурацкая, но 19.05-то должен закрыться раньше, независимо от 19.07

(4) у тебя зависают остатки на 19.05, положительные или отрицательные?

Положительные.

В течение квартала формируется отрицательное сальдо, документ "Восстановление НДС" должен был бы это все отправить на 68, но он отправляет больше - с учетом остатков за прошлый период!

Вообще, эта ерунда происходит только по документам, по которым были введены остатки в начале 2013 года, по документам поступления, которые уже были введены в базу - ничего подобного не происходит, то этих старых документов еще очень много.

смотри остатки по регистрам "НДС предъявленный" и "НДС предъявленный реал. 0%" по этим счетам-фактурам. Может там что-то на корректировали

(8) может оно не видит проведенную с.ф. и пытается восстановить весь входящий НДС

У нас какая-то доработанная версия, при заполнении документа "восстановлениеНДС" регистр "НДС предъявленный" не анализируется (а и зачем? Хоть это и не я правила), а по регистру "НДС предъявленный реал. 0%"  видно, что берутся именно остатки, в том числе - попадают те документы, по которым 19.05 уже был восстановлен в прошлом квартале, но подтверждения реализации в прошлом квартале не было. В этом, кстати, уже есть! Но сумма теперь зависла в регистре "НДС предъявленный реал. 0%" в состоянии "подтверждена" (а спишется только потом, документом формированиезпк0%)
Какую СФ не видит, я не поняла?

тогда вопрос к авторам тех доработок. Восстанавливаться должны отрицательные остатки по регистру "НДС предъявленный"

А откуда они там возьмутся? Из какого документа?

(13) например, списание товаров на деятельность необлагаемую НДС, или списание недостачи товаров по инвентраизации

+(12) точнее
Восстанавливаться должны отрицательные остатки по регистру "НДС предъявленный" за минусом остатков по регистрам "НДС предъявленный реал 0%", "НДС по ОС" и возможно каким-то ещё

Документа "списание товаров" у нас нет.
если идти по логике программы, то 19.05 по кредиту формируется из реализации на экспорт, и регистр НДС предъявленный реал. 0% оттуда же, а где параллельно 19.05 формируется отрицательный "НДС предъявленный"?

(16) если бы я делал "по логике", то я бы уменьшал регистр НДСПредъявленный при проводке Дт19.07Кт19.05. Но у разработчиков подсистемы НДС немного другая логика: они считают приход по регистру "НДС пред. реал. 0%" уменьшением "обычного" НДС, поэтому смотри уточнение (15).

+(14) отрицательные остатки могут образоваться, тупо если к вычету взяли больше чем положено (по ошибке или каким-либо другим причинам)

Спасибо большое за помощь, но я всё равно не разберусь никак!
Заполнила, кстати, документ сейчас "восстановление НДС" доп. обработкой по оборотам регистра "НДС предъявленный. реал. 0%" - 19.05 закрылся идеально.
Предположим, у нас механизм заполнения испорчен, не хочу там копаться, там еще один программист есть...
Как он должен был заполняться, чтобы закрыть 19.05? Или 19.05 не должен закрываться?
НДС предъявленный - НДС предъявленный. реал. 0% - и если остаток отрицательный, то попадает?
По НДС предъявленный у нас 0, так что то же самое и получается. Вопрос - по остаткам или по оборотам?

>Заполнила, кстати, документ сейчас "восстановление НДС" доп. обработкой по оборотам регистра "НДС предъявленный. реал. 0%" - 19.05 закрылся идеально.
значит типовой механизм сломали, а свою логику реализовали в этой доп. обработке
>Или 19.05 не должен закрываться?
Должен (по крайней мере отрицательных остатков на конец квартала точно быть не должно)
>НДС предъявленный - НДС предъявленный. реал. 0% - и если остаток отрицательный, то попадает?
Да, именно так.
>По НДС предъявленный у нас 0, так что то же самое и получается.
в вашем частном случае получается так
>Вопрос - по остаткам или по оборотам?
по остаткам, при этом сам документ Восстановление НДС эти остатки закрывает - в следующий документ они уже не попадут

похоже ваша проблема в последнем пункте (19):
Восстановление НДС при проведении балансирует остатки по регистру "НДС предъявленный. реал. 0%" остатками регистра "НДС предъявленный", а вы эти новые остатки игнорируете и снова берете только остатки "НДС предъявленный. реал. 0%"